Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMD1P0DJR0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMD1P0DJR0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms