Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RGPD2P0DJD1 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms