Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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