Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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PTPRCP08575 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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PTPRCP08575 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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