Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLK3P07288 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLK3P07288 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLK3P07288 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLK3P07288 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLK3P07288 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLK3P07288 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLK3P07288 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLK3P07288 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms