Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX7O95931 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms