Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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CLDN9O95484 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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CLDN9O95484 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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CLDN9O95484 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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CLDN9O95484 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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