Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOL3O95236 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL3O95236 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL3O95236 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL3O95236 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL3O95236 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL3O95236 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL3O95236 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL3O95236 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL3O95236 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL3O95236 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL3O95236 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL3O95236 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOL3O95236 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms