Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA4O75335 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms