Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIN3BO75182 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms