Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PPFIA3O75145 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms