Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NBNO60934 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NBNO60934 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NBNO60934 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NBNO60934 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NBNO60934 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NBNO60934 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NBNO60934 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NBNO60934 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NBNO60934 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NBNO60934 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NBNO60934 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NBNO60934 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NBNO60934 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NBNO60934 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NBNO60934 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NBNO60934 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NBNO60934 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NBNO60934 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NBNO60934 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NBNO60934 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NBNO60934 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NBNO60934 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NBNO60934 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NBNO60934 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NBNO60934 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NBNO60934 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBNO60934 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms