Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SLC25A20O43772 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms