Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms