Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms