Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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