Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX6Q9UPM6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms