Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms