Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK2

ATXN7L1, Ataxin-7-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L1Q9ULK2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L1Q9ULK2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L1Q9ULK2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L1Q9ULK2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L1Q9ULK2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L1Q9ULK2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATXN7L1Q9ULK2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATXN7L1Q9ULK2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATXN7L1Q9ULK2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATXN7L1Q9ULK2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATXN7L1Q9ULK2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATXN7L1Q9ULK2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN7L1Q9ULK2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms