Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF11Q9UIL8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms