Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms