Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
IFT172Q9UG01 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms