Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms