Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms