Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

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Length 4,599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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