Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD2Q9NZN4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD2Q9NZN4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD2Q9NZN4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD2Q9NZN4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD2Q9NZN4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms