Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms