Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms