Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms