Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms