Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms