Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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