Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms