Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms