Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NYXQ9GZU5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms