Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR88Q9GZN0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GPR88Q9GZN0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms