Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM5Q9C035 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms