Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF4Q9BZC1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF4Q9BZC1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms