Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD3Q9BZ95 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD3Q9BZ95 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms