Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms