Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms