Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms