Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms