Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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CDRT15Q96T59 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CDRT15Q96T59 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CDRT15Q96T59 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CDRT15Q96T59 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CDRT15Q96T59 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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