Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK3

ZNF607, Zinc finger protein 607, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF607Q96SK3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF607Q96SK3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms