Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms