Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms