Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms