Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHFRQ96EP1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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