Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGBD4Q96DM1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PGBD4Q96DM1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms